Walaupun bidang kerjasama industri China-ASEAN semakin meluas dan berpotensi besar, namun masih berdepan dengan tiga cabaran besar.
Pertama, struktur industri yang lebih kurang sama. Berbanding China, Singapura dan Malaysia memang memiliki kelebihan dalam perkilangan perkakas elektromekanik dan industri intensif modal yang lain, namun Vietnam dan Kemboja pula menjadi pesaing China dalam industri intensif buruh seperti perkilangan pakaian dan kasut.
Kedua, persaingan untuk menarik pelaburan asing amat sengit. China dan ASEAN kini dalam proses mendorong pengindustrian dan pembandaran, jadi masing-masing sedang giat memperbaiki persekitaran pelaburan untuk menarik pelaburan asing. Ini mewujudkan persaingan sengit untuk menarik pelaburan langsung asing.
Akhir sekali, kawal selia operasi pasaran masih rendah. Seiring dengan penubuhan Kawasan Perdagangan Bebas China-ASEAN, negara ASEAN telah menjadi destinasi pelaburan yang digemari syarikat-syarikat China. Namun, risiko tersembunyi seperti tahap pengawalseliaan pasaran yang rendah dan ketidakstabilan politik di sesetengah negara ASEAN mempengaruhi syarikat China yang ingin menerokai pasaran ASEAN.